Nahajate se tukaj

Računalniški pristop za pohitritev identifikacije virusov ter bakterij

Trenutna pandemija COVID-19 izpostavlja urgentno potrebo po hitri in zanesljivi detekciji nalezljivih bolezni. Vrsto virusne oziroma bakterijske okužbe lahko določimo s presejalnimi DNA testi v bioloških vzorcih pacientov. Postopek pa otežuje tako mala količina patogene DNA kot tudi interferenca s prevladujočo DNA, ki z boleznijo ni povezana. Znanstveniki tipično pristopijo k načrtovanju molekulskih sond, ki močno vežejo patogeno DNA, s preostalo DNA pa ne interagirajo. Raziskovalca iz Laboratorija za fizikalno kemijo in kemijsko termodinamiko dr. Tine Curk in izr.prof.dr. Urban Bren pa sta v sodelovanju z znanstveniki iz Velike Britanije in Kitajske z uporabo računalniških simulacij zasnovala boljši pristop. Delo bo v tem tednu objavljeno v Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA s faktorjem vpliva blizu 10. To je prva objava v tej prestižni multidisciplinarni reviji v zgodovini FKKT UM. Novost pristopa je v neintuitivnem načrtovanju sond, ki se preko šibkih multivalentnih interakcij vežejo na več različnih mest patogene DNA. Sedaj že izvajamo laboratorijske eksperimente, da bi ta inovativni pristop čim prej prenesli v vsakdanjo klinično prakso. Glede na urgentno globalno potrebo po hitrih, zanesljivih in poceni metodah identifikacije nalezljivih bolezni pa novi pristop izkazuje ogromen potencial še posebno za nerazvite države s šibko zdravstveno infrastrukturo.

Čestitamo!